故事讲述一名缉毒精英的闫鹏在追捕毒贩赤那时，自己的同事兼好兄弟阿古拉牺牲在了毒贩手中。闫鹏很是痛心来到了阿古拉的家中替他照顾家人。却不料碰上了真正的赤那来到了阿古拉的家中，准备让阿古拉的父亲带路逃出边境。在闫鹏万般疑…

本作开头将以第76话「柯南 vS.怪盗基德」首次对峙的全新影像画面展开，并会加入仅有在电视动画特别总集篇《名侦探柯南 vS. 怪盗基德》中才能看到的柯南和基德之间宝贵的「互动」全新画面。